Das Königlich-Belgische Institut für Naturwissenschaften handelt nicht allein. Es unterhält in Belgien zahlreiche fruchtbare Partnerschaften mit der öffentlichen Hand, Forschungseinrichtungen, Museen sowie mit VoG und NRO, die in den Bereichen Bildung und Wissenschaft tätig sind. Diese Partnerschaften tragen unter anderem zu Forschungsprojekten, den umfassenden Restaurierungsarbeiten des Museums, der Bewirtschaftung des ozeanographischen Forschungsschiffes Belgica und Wanderausstellungen bei. Nachfolgend ein kurzer Überblick über diese belgischen Partner.