Les collections de Paléontologie sont parmi les plus anciennes de l’Institut. On y compte actuellement plus de 3 millions de fossiles, essentiellement des vertébrés, des invertébrés et des plantes. Il s’agit également des collections les plus diversifiées tant en termes de groupes systématiques qu’en dimensions des spécimens. Ceux-ci vont en effet d’une taille inférieure à celle d’une cellule (nanofossiles) jusqu’à celle d’un dinosaure ou d’une baleine.