La recherche scientifique est principalement liée à l’étude des écosystèmes et de leur évolution afin de mieux les gérer et les protéger. Ceci se traduit par la participation à des projets scientifiques, par des publications dans la littérature avec comité de lecture et par la participation à des conférences nationales et internationales ainsi qu’à des groupes de travail spécialisés. La recherche a aussi pour but le développement d’outils scientifiques et constitue le socle sur lequel est basée l’expertise scientifique dispensée dans l’intérêt public.

Cette recherche peut être appliquée aux mers et océans, environnements d’eaux douces et terrestres, au niveau mondial.